| 番匠川水系 | 乙津川
(左岸)大野川からの分派点から海まで
(右岸)大野川からの分派点から海まで | 大分県 | 大分地方気象台 |
| 判田川 | (左岸)大分県大分市大字下判田字迫1732番の1地先から大野川への合流点まで
(右岸)大分県大分市大字下判田字小路1712番の1地先から大野川への合流点まで |
| 立小野川 | (左岸)大分県大分市大字下判田字屋敷田3942の8地先の国道橋から判田川への合流点まで
(右岸)大分県大分市大字下判田字屋敷田3942の8地先の国道橋から判田川への合流点まで |
| 駅館川水系駅館川 | 番匠川
(左岸)大分県佐伯市本匠大字波寄字川平1988番1地先の取水堰下流端から海まで
(右岸)大分県佐伯市本匠大字波寄字カジヤ1251番地先の取水堰下流端から海まで |
| 井崎川 | (左岸)大分県佐伯市弥生大字大坂本字小浪1216番の2地先から番匠川への合流点まで
(右岸)大分県佐伯市弥生大字大坂本字ケゴヤ2363番の1地先から番匠川への合流点まで | 大分県 | 大分地方気象台 |
| 駅館川 | (左岸)大分県宇佐市大字山本字ムクノ垣1735番地先から河口まで
(右岸)大分県宇佐市大字上拝田字筒井735番地先から河口まで |
| 五ヶ瀬川・大瀬川 | 大瀬川
(左岸)五ヶ瀬川からの分派点から海まで
(右岸)五ヶ瀬川からの分派点から海まで | 宮崎県 | 宮崎地方気象台 |
| 五ヶ瀬川 | (左岸)宮崎県延岡市貝の畑町2413番の1地先から海まで
(右岸)宮崎県延岡市下三輪町1661番の25地先から海まで |