| 淀川水系高時川 | 高時川(左岸)滋賀県長浜市木之本町川合から姉川合流点まで(右岸)滋賀県長浜市木之本町川合から姉川合流点まで | 滋賀県 | 彦根地方気象台 |
| 淀川水系柚川 | 柚川(左岸)滋賀県甲賀市甲南町杉谷から野洲川合流まで(右岸)滋賀県甲賀市甲南町森尻から野洲川合流まで | 滋賀県 | 彦根地方気象台 |
| 淀川水系琵琶湖 | 琵琶湖琵琶湖湖岸 | 滋賀県 | 彦根地方気象台 |
| 由良川下流 | 由良川(左岸)京都府福知山市字前田地先から海まで(右岸)京都府福知山市字猪崎地先から海まで | 京都府 | 京都地方気象台 |
| 土師川 | (左岸)京都府福知山市字堀地先から由良川への合流点まで(右岸)京都府福知山市字土師地先から由良川への合流点まで | | |
| 由良川中流 | 由良川(左岸)京都府綾部市野田町西ノ谷105番地先から京都府福知山市字前田地先まで(右岸)京都府綾部市味方町鷲谷6番地先から京都府福知山市字猪崎地先まで | 京都府 | 京都地方気象台 |
| 淀川水系鴨川・高野川 | 高野川(左岸)京都府京都市左京区上高野奥小森町21番1地先から鴨川合流点まで(右岸)京都府京都市左京区八瀬野瀬町64地先から鴨川合流点まで | 京都府 | 京都地方気象台 |
| 鴨川 | (左岸)京都府京都市北区上賀茂北ノ原町1番6地先から桂川合流点まで(右岸)京都府京都市北区西賀茂上庄田町16番6地先から桂川合流点まで | | |
| 淀川水系桂川中流・園部川 | 桂川(左岸)京都府南丹市日吉町中大向9番地1地先から京都府亀岡市保津町立岩1番地2地先まで(右岸)京都府南丹市日吉町中五味向5番地先から京都府亀岡市篠町山本下太田20番地先まで | 京都府 | 京都地方気象台 |
| 園部川 | (左岸)本梅川合流点から桂川合流点まで(右岸)本梅川合流点から桂川合流点まで | | |