| 子吉川 | 秋田県 | 秋田地方気象台 |
| (左岸)秋田県由利本荘市吉沢堰根川原2番の11地先から海まで | | |
| (右岸)秋田県由利本荘市吉沢字百地2番地先から海まで | | |
| 太平川 | 秋田県 | 秋田地方気象台 |
| (左岸)秋田県秋田市太平山谷字鵡ノ島地先(地主橋)から旭川合流点まで | | |
| (右岸)秋田県秋田市太平山谷字地主地先(地主橋)から旭川合流点まで | | |
| 最上川上流 | 山形県 | 山形地方気象台 |
| (左岸)山形県米沢市中田町字堀立川向一21番の乙地先から山形県村山市大字田沢字小野原907の65まで | | |
| (右岸)山形県米沢市大字花沢字八木橋西上3616番地先から山形県村山市大字土生田字高橋1515の2まで | | |
| 吉野川 | | |
| (左岸)山形県南陽市大橋下宿浦1043番の3地先の鉄道橋下流端から最上川合流点まで | | |
| (右岸)山形県南陽市大橋下宿浦1043番の3地先の鉄道橋下流端から最上川合流点まで | | |
| 鬼面川 | | |
| (左岸)山形県東置賜郡高畠町大字上平柳字下在家1937番の14地先から最上川合流点まで | | |
| (右岸)山形県東置賜郡高畠町大字上平柳字北五百野1954番の9地先から最上川合流点まで | | |
| 天王川 | | |
| (左岸)山形県米沢市大字下新田字袖谷地516番地先の県道橋下流端から最上川合流点まで | | |
| (右岸)山形県米沢市大字下新田字袖谷地516番地先の県道橋下流端から最上川合流点まで | | |
| 誕生川 | | |
| (左岸)山形県東置賜郡川西町大字高山字八幡堂東900番地先の県道橋下流端から最上川合流点まで | | |
| (右岸)山形県東置賜郡川西町大字高山字八幡堂東900番地先の県道橋下流端から最上川合流点まで | | |
| 置賜白川 | | |
| (左岸)山形県長井市時庭字中島川原564番の9地先から最上川合流点まで | | |
| (右岸)山形県長井市歌丸字下川原一2182番の9地先から最上川合流点まで | | |
| 村山野川 | | |
| (左岸)山形県東根市大字野田シタ舟戸橋1090番地先から最上川合流点まで | | |
| (右岸)山形県東根市大字野田シタ舟戸橋1353番地先から最上川合流点まで | | |